MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	ACG	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017377	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017377	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017377	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
5	NC_017377	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229300
6	NC_017377	CAA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
7	NC_017377	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
8	NC_017377	AATAC	2	10	696	705	60 %	20 %	0 %	20 %	385229300
9	NC_017377	A	9	9	709	717	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
10	NC_017377	ACA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
11	NC_017377	AT	3	6	911	916	50 %	50 %	0 %	0 %	385229300
12	NC_017377	TG	3	6	919	924	0 %	50 %	50 %	0 %	385229300
13	NC_017377	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
14	NC_017377	ACGCA	2	10	1117	1126	40 %	0 %	20 %	40 %	385229300
15	NC_017377	GAAC	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
16	NC_017377	AAAAC	2	10	1163	1172	80 %	0 %	0 %	20 %	385229300
17	NC_017377	AAG	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
18	NC_017377	AGA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
19	NC_017377	A	7	7	1305	1311	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
20	NC_017377	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
21	NC_017377	CCAA	2	8	1334	1341	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
22	NC_017377	CAAAG	2	10	1455	1464	60 %	0 %	20 %	20 %	385229300
23	NC_017377	A	7	7	1468	1474	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
24	NC_017377	GAA	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
25	NC_017377	CAAG	2	8	1494	1501	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
26	NC_017377	CAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
27	NC_017377	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
28	NC_017377	CA	3	6	1551	1556	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
29	NC_017377	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
30	NC_017377	T	7	7	1582	1588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017377	ATT	2	6	1622	1627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017377	AGC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229301
33	NC_017377	TAA	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017377	AAT	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017377	A	7	7	1902	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017377	TAAA	2	8	1919	1926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017377	A	6	6	1924	1929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017377	GTC	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017377	G	6	6	2018	2023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017377	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017377	G	6	6	2082	2087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017377	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017377	TC	3	6	2158	2163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017377	TCCA	2	8	2197	2204	25 %	25 %	0 %	50 %	385229302
45	NC_017377	GTTGT	2	10	2205	2214	0 %	60 %	40 %	0 %	385229302
46	NC_017377	AAG	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229302
47	NC_017377	CTTG	2	8	2381	2388	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
48	NC_017377	GTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
49	NC_017377	TTTGA	2	10	2457	2466	20 %	60 %	20 %	0 %	385229302
50	NC_017377	TTG	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
51	NC_017377	CT	4	8	2573	2580	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
52	NC_017377	CT	4	8	2582	2589	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
53	NC_017377	GT	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	385229302
54	NC_017377	CT	3	6	2644	2649	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
55	NC_017377	CTG	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229302
56	NC_017377	TTGC	2	8	2780	2787	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
57	NC_017377	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	385229302
58	NC_017377	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229302
59	NC_017377	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	385229302
60	NC_017377	GTT	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017377	CTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017377	TCCTTG	2	12	2986	2997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017377	CTA	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017377	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017377	TGT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017377	TTG	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017377	CT	3	6	3199	3204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017377	T	6	6	3232	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017377	TAG	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017377	GTT	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017377	GTT	3	9	3273	3281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017377	GA	3	6	3304	3309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017377	TGT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017377	TCA	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017377	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017377	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017377	CCTTG	2	10	3504	3513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017377	TAT	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017377	TGT	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017377	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017377	TAG	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017377	TC	3	6	3793	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017377	TG	3	6	3847	3852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017377	TGT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017377	CAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017377	CA	3	6	3976	3981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017377	TGAG	2	8	3995	4002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017377	AG	4	8	4001	4008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017377	TTAG	2	8	4019	4026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017377	GTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
91	NC_017377	GATTT	2	10	4244	4253	20 %	60 %	20 %	0 %	385229303
92	NC_017377	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229303
93	NC_017377	T	6	6	4313	4318	0 %	100 %	0 %	0 %	385229303
94	NC_017377	TTG	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
95	NC_017377	AG	3	6	4353	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	385229303
96	NC_017377	T	7	7	4386	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	385229303
97	NC_017377	TGTTT	2	10	4480	4489	0 %	80 %	20 %	0 %	385229303
98	NC_017377	G	7	7	4515	4521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017377	ATTTT	2	10	4607	4616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017377	GTT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017377	TGAT	2	8	4655	4662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017377	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	385229304
103	NC_017377	AAAGT	2	10	4756	4765	60 %	20 %	20 %	0 %	385229304
104	NC_017377	AAGA	2	8	4818	4825	75 %	0 %	25 %	0 %	385229304
105	NC_017377	AT	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	385229304
106	NC_017377	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229304
107	NC_017377	A	7	7	4865	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	385229304
108	NC_017377	TTA	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229304
109	NC_017377	A	6	6	4987	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
110	NC_017377	A	6	6	5011	5016	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
111	NC_017377	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
112	NC_017377	AC	3	6	5126	5131	50 %	0 %	0 %	50 %	385229305
113	NC_017377	AG	3	6	5141	5146	50 %	0 %	50 %	0 %	385229305
114	NC_017377	GTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229305
115	NC_017377	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017377	GAAT	2	8	5265	5272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017377	ATC	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017377	TGAA	2	8	5306	5313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017377	ATT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017377	A	7	7	5387	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017377	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017377	ATCA	2	8	5471	5478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017377	AGCG	2	8	5499	5506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017377	CAA	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229306
125	NC_017377	A	6	6	5683	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	385229306
126	NC_017377	TAAAAC	2	12	5693	5704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017377	GTT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017377	TTA	2	6	5738	5743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017377	T	6	6	5765	5770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017377	GC	4	8	5785	5792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017377	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017377	GGA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017377	AG	3	6	6106	6111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017377	AGG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017377	TTAT	2	8	6220	6227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017377	TTA	2	6	6267	6272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017377	ATCA	2	8	6308	6315	50 %	25 %	0 %	25 %	385229307
138	NC_017377	A	6	6	6391	6396	100 %	0 %	0 %	0 %	385229307
139	NC_017377	GAA	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
140	NC_017377	CAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
141	NC_017377	ACC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
142	NC_017377	TAA	2	6	6528	6533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229307
143	NC_017377	ATT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
144	NC_017377	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	385229307
145	NC_017377	ACA	2	6	6713	6718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
146	NC_017377	ATT	2	6	6739	6744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
147	NC_017377	AG	3	6	6745	6750	50 %	0 %	50 %	0 %	385229307
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269	NC_017377	CAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.